MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 5530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	CTT	2	6	303	308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849397
2	NC_019976	GTC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849397
3	NC_019976	CGT	2	6	552	557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849397
4	NC_019976	CTTCTC	2	12	601	612	0 %	50 %	0 %	50 %	435849397
5	NC_019976	TCTGGA	2	12	623	634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435849397
6	NC_019976	TCC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849397
7	NC_019976	CTC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849397
8	NC_019976	TGT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849397
9	NC_019976	TCA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849397
10	NC_019976	AGTC	2	8	832	839	25 %	25 %	25 %	25 %	435849397
11	NC_019976	CGAG	2	8	899	906	25 %	0 %	50 %	25 %	435849397
12	NC_019976	CAGC	2	8	912	919	25 %	0 %	25 %	50 %	435849397
13	NC_019976	GTT	2	6	920	925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849397
14	NC_019976	ACC	2	6	934	939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849397
15	NC_019976	AAT	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849398
16	NC_019976	AAAG	2	8	1220	1227	75 %	0 %	25 %	0 %	435849398
17	NC_019976	GAA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
18	NC_019976	TGA	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
19	NC_019976	CAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
20	NC_019976	CTT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849398
21	NC_019976	CTG	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849398
22	NC_019976	CGA	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
23	NC_019976	TCGA	2	8	1587	1594	25 %	25 %	25 %	25 %	435849398
24	NC_019976	CGA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
25	NC_019976	AAG	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
26	NC_019976	ATG	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
27	NC_019976	CGAA	2	8	1812	1819	50 %	0 %	25 %	25 %	435849398
28	NC_019976	TCC	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849398
29	NC_019976	TGA	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
30	NC_019976	TG	3	6	1893	1898	0 %	50 %	50 %	0 %	435849398
31	NC_019976	CTC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849398
32	NC_019976	ATG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
33	NC_019976	ACT	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849398
34	NC_019976	AGA	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
35	NC_019976	GGAA	2	8	2116	2123	50 %	0 %	50 %	0 %	435849398
36	NC_019976	TCG	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849398
37	NC_019976	AGG	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849398
38	NC_019976	CTTAT	2	10	2867	2876	20 %	60 %	0 %	20 %	435849399
39	NC_019976	CAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
40	NC_019976	CTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
41	NC_019976	ATC	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
42	NC_019976	GTC	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
43	NC_019976	TGA	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
44	NC_019976	CGA	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
45	NC_019976	GTCA	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	435849399
46	NC_019976	ACC	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849399
47	NC_019976	GCG	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849399
48	NC_019976	ATGAG	2	10	3182	3191	40 %	20 %	40 %	0 %	435849399
49	NC_019976	TCG	2	6	3260	3265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
50	NC_019976	CGT	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
51	NC_019976	TAA	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849399
52	NC_019976	AG	3	6	3343	3348	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
53	NC_019976	CAA	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849399
54	NC_019976	GCCA	2	8	3463	3470	25 %	0 %	25 %	50 %	435849399
55	NC_019976	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849399
56	NC_019976	GA	3	6	3599	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
57	NC_019976	CTG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
58	NC_019976	GTA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
59	NC_019976	ACC	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849399
60	NC_019976	AAC	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849399
61	NC_019976	TCG	3	9	3704	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
62	NC_019976	AG	3	6	3745	3750	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
63	NC_019976	AGCA	2	8	3802	3809	50 %	0 %	25 %	25 %	435849399
64	NC_019976	TCC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849399
65	NC_019976	GAAG	2	8	3902	3909	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
66	NC_019976	ATC	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
67	NC_019976	GAG	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849399
68	NC_019976	ACG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
69	NC_019976	GGAA	2	8	4018	4025	50 %	0 %	50 %	0 %	435849399
70	NC_019976	TAG	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
71	NC_019976	GACG	2	8	4125	4132	25 %	0 %	50 %	25 %	435849399
72	NC_019976	GAC	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
73	NC_019976	CTC	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849399
74	NC_019976	TCG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
75	NC_019976	GA	3	6	4973	4978	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
76	NC_019976	CAT	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
77	NC_019976	TGA	2	6	5013	5018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849400
78	NC_019976	TTG	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
79	NC_019976	T	6	6	5176	5181	0 %	100 %	0 %	0 %	435849400
80	NC_019976	T	6	6	5200	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	435849400
81	NC_019976	AATC	2	8	5296	5303	50 %	25 %	0 %	25 %	435849400
82	NC_019976	TGCC	2	8	5323	5330	0 %	25 %	25 %	50 %	435849400
83	NC_019976	AAC	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849400
84	NC_019976	CAG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849400
85	NC_019976	CTC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849400
86	NC_019976	GTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
87	NC_019976	CGT	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
88	NC_019976	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849400
89	NC_019976	GA	3	6	5588	5593	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
90	NC_019976	GTT	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
91	NC_019976	CG	3	6	5668	5673	0 %	0 %	50 %	50 %	435849400
92	NC_019976	ATC	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
93	NC_019976	TCG	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
94	NC_019976	TGCGT	2	10	5741	5750	0 %	40 %	40 %	20 %	435849400
95	NC_019976	TGT	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
96	NC_019976	GTGA	2	8	5796	5803	25 %	25 %	50 %	0 %	435849400
97	NC_019976	CCTG	2	8	5858	5865	0 %	25 %	25 %	50 %	435849400
98	NC_019976	TTC	2	6	5924	5929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849400
99	NC_019976	ATC	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
100	NC_019976	TC	3	6	5988	5993	0 %	50 %	0 %	50 %	435849400
101	NC_019976	GA	3	6	6040	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	435849400
102	NC_019976	GGCA	2	8	6076	6083	25 %	0 %	50 %	25 %	435849400
103	NC_019976	GGA	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849400
104	NC_019976	ATC	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
105	NC_019976	CGG	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849400
106	NC_019976	TCG	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
107	NC_019976	AGT	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849401
108	NC_019976	AATC	2	8	7626	7633	50 %	25 %	0 %	25 %	435849401
109	NC_019976	CGT	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
110	NC_019976	CGCT	2	8	7727	7734	0 %	25 %	25 %	50 %	435849401
111	NC_019976	GCT	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
112	NC_019976	CTC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
113	NC_019976	ACG	2	6	7806	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849401
114	NC_019976	GATC	2	8	7857	7864	25 %	25 %	25 %	25 %	435849401
115	NC_019976	CTC	2	6	7981	7986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
116	NC_019976	CGT	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
117	NC_019976	T	6	6	7992	7997	0 %	100 %	0 %	0 %	435849401
118	NC_019976	CGC	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849401
119	NC_019976	ATC	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
120	NC_019976	CGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
121	NC_019976	GCTT	2	8	8073	8080	0 %	50 %	25 %	25 %	435849401
122	NC_019976	TTCG	2	8	8085	8092	0 %	50 %	25 %	25 %	435849401
123	NC_019976	TTGA	2	8	8107	8114	25 %	50 %	25 %	0 %	435849401
124	NC_019976	GTT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849401
125	NC_019976	GTC	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
126	NC_019976	TCC	2	6	8192	8197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
127	NC_019976	TCG	3	9	8255	8263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
128	NC_019976	CGTCG	2	10	8276	8285	0 %	20 %	40 %	40 %	435849401
129	NC_019976	TTC	2	6	8336	8341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
130	NC_019976	TCG	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
131	NC_019976	TGC	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
132	NC_019976	TCC	2	6	8549	8554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
133	NC_019976	TTC	2	6	8599	8604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
134	NC_019976	CCTG	2	8	8675	8682	0 %	25 %	25 %	50 %	435849401
135	NC_019976	TCGAT	2	10	8753	8762	20 %	40 %	20 %	20 %	435849401
136	NC_019976	TCG	2	6	8801	8806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
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138	NC_019976	ATC	2	6	8968	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
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142	NC_019976	TCG	2	6	9080	9085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
143	NC_019976	ATC	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
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250	NC_019976	ATC	2	6	16537	16542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849407
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258	NC_019976	TGG	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849407
259	NC_019976	CGT	2	6	17094	17099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849407
260	NC_019976	TCGC	2	8	17112	17119	0 %	25 %	25 %	50 %	435849407
261	NC_019976	GA	3	6	17178	17183	50 %	0 %	50 %	0 %	435849407
262	NC_019976	GAAC	2	8	17206	17213	50 %	0 %	25 %	25 %	435849407
263	NC_019976	CGA	2	6	17235	17240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849407
264	NC_019976	GAC	2	6	17272	17277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849407
265	NC_019976	ATC	2	6	17348	17353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849407
266	NC_019976	CGATCG	2	12	17499	17510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	435849407
267	NC_019976	TACT	2	8	17530	17537	25 %	50 %	0 %	25 %	435849407
268	NC_019976	GGTC	2	8	17543	17550	0 %	25 %	50 %	25 %	435849407
269	NC_019976	ACT	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849407
270	NC_019976	GAC	2	6	17612	17617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849407
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273	NC_019976	TCG	2	6	17766	17771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849407
274	NC_019976	GACG	2	8	17800	17807	25 %	0 %	50 %	25 %	435849407
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279	NC_019976	TCA	2	6	19045	19050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849408
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281	NC_019976	GA	3	6	19077	19082	50 %	0 %	50 %	0 %	435849408
282	NC_019976	ATC	2	6	19092	19097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849408
283	NC_019976	ATCG	2	8	19100	19107	25 %	25 %	25 %	25 %	435849408
284	NC_019976	GAG	2	6	19168	19173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849408
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292	NC_019976	CGGA	2	8	19513	19520	25 %	0 %	50 %	25 %	435849409
293	NC_019976	CGA	2	6	19555	19560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849409
294	NC_019976	CCA	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849409
295	NC_019976	CGA	2	6	19593	19598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849409
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301	NC_019976	AGTC	2	8	20250	20257	25 %	25 %	25 %	25 %	435849410
302	NC_019976	TGC	2	6	20332	20337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849410
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380	NC_019976	CGAG	2	8	24678	24685	25 %	0 %	50 %	25 %	435849413
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383	NC_019976	TC	3	6	24780	24785	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
384	NC_019976	CT	3	6	24809	24814	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
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386	NC_019976	ACG	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
387	NC_019976	CGA	2	6	24918	24923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
388	NC_019976	CTG	2	6	24925	24930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
389	NC_019976	ATCGAT	2	12	24964	24975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435849413
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496	NC_019976	GTG	2	6	33357	33362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849422
497	NC_019976	GAA	2	6	33422	33427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849422
498	NC_019976	CTTG	2	8	33580	33587	0 %	50 %	25 %	25 %	435849422
499	NC_019976	GAA	3	9	33614	33622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849422
500	NC_019976	ACGT	2	8	33638	33645	25 %	25 %	25 %	25 %	435849422

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